提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
山西汾酒2022年营收预计超260亿元******
1月19日晚,山西汾酒发布业绩预报。2022年,公司预计实现营业收入260亿元左右,同比增长30%左右。归属于上市公司股东的净利润79亿元左右,同比增长49%左右。
2022年,山西汾酒面对国内点状爆发、反复出现的新冠疫情,公司按照既定的经营计划,统筹内外部资源,提前安排部署,扎实推进各项工作,以公司发展的确定性应对外部环境的不确定性,保持了稳健增长的发展态势。
报告还披露,公司不断拓展市场,深耕终端,全国可掌控终端数量突破112万家,同时加速市场管理升级,实现了终端动销可视化溯源管理。据业内人士介绍,目前无论就终端数量规模还是动销可视化溯源管理,汾酒均达到了一定先进程度。
报告还指出,长江以南市场实现稳步突破,同比增长超过50%。近年来,随着深耕江、浙、沪、皖、粤等经济发达地区,汾酒高端市场的份额持续增长。报告中提到,青花汾酒全系列同比增长达60%,随着酒类市场的消费升级,山西汾酒坚持将产品重点向青花全系列的高端产品发力。
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |